Este es un caso clásico de muchos a muchos, y para eso necesitará una tercera tabla entre Curso y Estudiante. El esquema se verá así:
Course
la tabla tiene columnas ("course_id", "course_name")
Student_course
la tabla tiene columnas ("student_id", "course_id");
Student
tabla como columnas ("student_id", "student_name")
La tabla Student_course tiene restricciones de clave externa tanto en las tablas de estudiantes como en las de cursos.
Datos de ejemplo:
Curso:
id | name
------------------
1 | Maths
2 | English
3 | Science
Estudiante
id | name
---------------
1 | Tom
2 | Dick
3 | Harry
Estudiante_curso
student_id | course_id
------------------------
1 | 1
1 | 2
2 | 1
3 | 3
En este ejemplo, el Estudiante 1 (Tom) está en los cursos 1 y 2 (Matemáticas, Inglés),
El estudiante 2 (Dick) está solo en el curso 1 (Matemáticas)
El estudiante 3 (Harry) está solo en el curso 3 (Ciencias)