Necesitará escribir una extensión para Liquibase que pueda consultar Postgres para obtener la lista de funciones, así como el código para generar el SQL correcto para que Postgres elimine funciones. Este no será un ejercicio trivial.
Los conceptos básicos para escribir una extensión de Liquibase se describen en el sitio web de Liquibase , pero requeriría una buena cantidad de aprendizaje para comprender las partes internas de Liquibase.