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¿Cómo contar filas relacionadas, incluidas las subcategorías?

Esto hace el trabajo para un single nivel de anidamiento:

Para enumerar solo las categorías raíz, los conteos incluyen subcategorías:

WITH root AS (
   SELECT id AS cat_id, id AS sub_id
   FROM   category
   WHERE  is_base_template = false
   AND    "userId" = 1
   )
SELECT c.cat_id, count(*)::int AS entries_in_cat
FROM  (
   TABLE root
   UNION ALL
   SELECT r.cat_id, c.id
   FROM   root     r
   JOIN   category c ON c."parentCategoryId" = r.cat_id
   ) c
JOIN   category_entries_entry e ON e."categoryId" = c.sub_id
GROUP  BY c.cat_id;

El punto es unirse en sub_id , pero agrupar por cat_id .

Para enumerar categorías raíz como las anteriores y subcategorías además :

WITH root AS (
   SELECT id AS cat_id, id AS sub_id
   FROM   category
   WHERE  is_base_template = false
   AND    "userId" = 1
   )
, ct AS (
   SELECT c.cat_id, c.sub_id, count(*)::int AS ct
   FROM  (
      TABLE root
      UNION ALL
      SELECT r.cat_id, c.id AS sub_id
      FROM   root     r
      JOIN   category c ON c."parentCategoryId" = r.cat_id
      ) c
   JOIN   category_entries_entry e ON e."categoryId" = c.sub_id
   GROUP  BY c.cat_id, c.sub_id
   )
SELECT cat_id, sum(ct)::int AS entries_in_cat
FROM   ct
GROUP  BY 1

UNION ALL
SELECT sub_id, ct
FROM   ct
WHERE  cat_id <> sub_id;

db<>fiddle aquí

Para un número arbitrario de niveles de anidamiento, use un CTE recursivo. Ejemplo:

Acerca de la sintaxis abreviada opcional TABLE parent :