Debe crear un método de limpieza personalizado en su modelo.
from django.core.exceptions import ValidationError
from django.db import models
class MyModel(models.Model):
user = models.ForeignKey(User)
is_active = models.BooleanField(default=False)
#...more fields ...
def clean(self):
if not self.pk and MyModel.objects.filter(user=self.user, is_active=True).exists():
raise ValidationError('How about no?')