Finalmente encontré la respuesta con la ayuda de mi colega. Parece que liquibase no conoce esos tipos, por lo que debemos modificar la consulta sql manualmente:
<createTable tableName="t_name">
...
<column name="doubleArray" type="DOUBLE_ARRAY"/>
...
</createTable>
<modifySql dbms="postgresql">
<replace replace="DOUBLE_ARRAY" with="double precision[][]"/>
</modifySql>