Uso de la condición If en la cláusula where

select * from sampleTable
where 
  case when @taxtype = 'P' then
    (taxtype = 'P' or  (taxtype = 'E' and code in ('MER','SER')))
  Else
    (taxtype = 'E' and code not in ('MER','SER'))
  end

Parece esto funcionará con Postres

Editar:

Dejo mi respuesta original porque la esencia funciona pero Postgres no tiene un concepto de variables como otros RDBMS, así que reescribí esto como

WITH myconstants as (SELECT 'P'::text as vtaxtype)

select * from sampleTable
where 
  case when (select vTaxType from myconstants) = 'P' then
    (taxtype = 'P' or  (taxtype = 'E' and code in ('MER','SER')))
  Else
    (taxtype = 'E' and code not in ('MER','SER'))
  end;

Aquí hay un SQL Fiddle mostrando que