Esto está mal:
Está ejecutando psql desde dentro de psql pero "psql" no es una instrucción SQL.
Debe ejecutar directamente desde el símbolo del sistema:
[email protected]:/home/naveen$ psql -U admin -d docmgr -f /var/www/html/docmgr/application/assets/dd/structs/docmgr_21Oct2016.sql
O desde dentro psql necesitas usar el \i comando para ejecutar un script SQL:
[email protected]:/home/naveen$ psql -U admin docmgr
Password for user admin: psql (9.5.4) Type "help" for help.
docmgr=> \i /var/www/html/docmgr/application/assets/dd/structs/docmgr_21Oct2016.sql
