Para usar migraciones con BDR, debe crear sus migraciones a mano, usando solo operaciones "seguras", porque BDR actualmente no puede replicar operaciones como la de su migración.
En una conversación por correo electrónico que tuve recientemente con el soporte de 2nd Quadrant (los principales patrocinadores del desarrollo de BDR), me dieron esta información sobre el tema:
También encontré este artículo de BrainTree ser una gran referencia para lo que podría considerarse operaciones "seguras" y cómo tendría que reescribir el comportamiento en sus migraciones.