Esto es esperado y documentado.
Tu puedes use CTE encadenados para eliminar la empresa:
with deleted_emp as (
delete from employee
where id = 1
returning company_id, id as employee_id
)
delete from company
where id in (select company_id from deleted_emp)
and not exists (select *
from employee e
join deleted_emp af
on af.company_id = e.company_id
and e.id <> af.employee_id)
Es importante excluir al empleado recién eliminado de not exists
subconsulta ya que siempre será visible en la segunda declaración de eliminación y, por lo tanto, no existe nunca sería cierto. Entonces, la subconsulta esencialmente verifica si hay un empleado que no sea el eliminado asignado a la misma empresa.
Ejemplo en línea:https://rextester.com/IVZ78695