Asegúrese de que el atributo paranoico esté definido dentro del parámetro del segundo objeto.
..., {
classMethods: {
associate: function(models) {
Collection.belongsTo(models.User,{ foreignKey: 'userId' })
}
},
timestamps: true,
paranoid: true
}
Ha definido paranoico como 3. Param y ese es el problema.