Publiqué el problema en gitlab, lo que me ayudó a solucionarlo.https:/ /gitlab.com/gitlab-org/omnibus-gitlab/issues/277
En caso de que alguien más tenga este problema o se encuentre con esto, estoy publicando un resumen rápido de cómo lo solucioné. En mi caso, me faltaban algunas relaciones DB. Entonces puede verificar eso ejecutando sudo gitlab-rake db:migrate:status Si alguno de esos dice abajo, entonces no se aplicaron.
Puede intentar solucionarlo ejecutando sudo gitlab-ctl reconfigure en mi caso eso no soluciono el problema. Tuve que indicarle manualmente que ejecutara las migraciones de base de datos con el siguiente comando sudo gitlab-rake db:migrate
Después de eso, cuando ejecuté sudo gitlab-rake db:migrate:status todos estaban arriba y no tengo más de 500 errores al usar el sitio web.
