PostgreSQL CROSS JOIN indexación para rendimiento

Tu principal problema es el OR — nunca podrá obtener un rendimiento decente mientras tenga un OR así en tu WHERE cláusula.

Reescriba la consulta de la siguiente manera:

SELECT * FROM main_transaction t 
   JOIN main_profile p ON t.profile_id = p.id
   JOIN main_customer c ON p.user_id = c.id 
WHERE upper(t.request_no) LIKE upper(concat('%','0-90-6 12 ','%'))
UNION
SELECT * FROM main_transaction t 
   JOIN main_profile p ON t.profile_id = p.id
   JOIN main_customer c ON p.user_id = c.id 
WHERE upper(c.phone) LIKE upper(concat('%','0-90-6 12','%'));

Luego, asegúrese de tener los siguientes índices (aparte de los índices en el id s):

CREATE INDEX ON main_transaction (profile_id);
CREATE INDEX ON main_transaction USING gin (upper(request_no) gin_trgm_ops);
CREATE INDEX ON main_profile (user_id);
CREATE INDEX ON main_customer USING gin (upper(phone) gin_trgm_ops);

Eso debería marcar la diferencia.