Probablemente puedas hacerlo desde la línea de comando sin usar archivos:
pg_dump -U user --schema='fromschema' database | sed 's/fromschmea/toschema/g' | psql -U user -d database
Nota que esto busca y reemplaza todas las apariciones de la cadena que es su nombre de esquema, por lo que puede afectar sus datos .
