Citando el manual para ext/mysqli
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Si necesita solo una de esas características y puede pagar la refactorización, entonces sí, hágalo. Si no necesita ninguna de esas características, entonces no lo haga. No hay razón para refactorizar si no hay beneficios.
En una nota al margen, los rumores son ciertos. ext/mysql probablemente ser obsoleto (aunque nadie puede decir cuándo en el momento de escribir este artículo. Ciertamente no quedará obsoleto con 5.4. y probablemente estará disponible como una extensión de pecl para siempre) En cualquier caso, ya no debería comenzar ningún proyecto nuevo con ext/mysql cuando tienes una extensión superior para empezar.
Consulte también http://blog.ulf- wendel.de/2012/php-mysql-por-qué-actualizar-extmysql/