Con Eloquent puede hacer lo siguiente:
$match = "
match (
`title`,
`description`
) against (
?
IN BOOLEAN MODE
)";
$against = 'bar';
$sql->whereRaw($match, array($against));
$sql->orderByRaw($match . " DESC", array($against));
Lo mismo funcionaría con Query Builder, pero luego tienes que reescribir un poco.