Desaparece la restricción de clave externa de MySQL

Solo para aclarar las cosas, así es como se ve la tabla después de que se hayan implementado las restricciones de clave externa:

CREATE TABLE `leerplan_oefenreeks` (
  `leerplan_oefenreeks_id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `leerplan_id` int(11) NOT NULL,
  `oefenreeks_id` int(11) NOT NULL,
  `plaats` int(11) NOT NULL,
  PRIMARY KEY (`leerplan_oefenreeks_id`),
  KEY `fk_leerp_oefenr_leerplan` (`leerplan_id`),
  KEY `fk_leerp_oefenr_oefenreeks` (`oefenreeks_id`),
  CONSTRAINT `fk_leerp_oefenr_oefenreeks` FOREIGN KEY (`oefenreeks_id`) REFERENCES `oefenreeks` (`oefenreeks_id`) ON DELETE CASCADE,
  CONSTRAINT `fk_leerp_oefenr_leerplan` FOREIGN KEY (`leerplan_id`) REFERENCES `leerplan` (`leerplan_id`) ON DELETE CASCADE
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1 ;

Observe que los índices fk_leerp_oefenr_leerplan y fk_leerp_oefenr_oefenreeks mysql se agregan automáticamente.

Después de agregar la primera restricción de clave única:

ALTER TABLE leerplan_oefenreeks ADD CONSTRAINT un_leerp_oefenr UNIQUE(leerplan_id, oefenreeks_id);

Mysql elimina el índice fk_leerp_oefenr_leerplan ya que ya no es necesario para admitir las comprobaciones de clave externa en la columna leerplan_id. En este punto, la tabla se ve así:

CREATE TABLE `leerplan_oefenreeks` (
  `leerplan_oefenreeks_id` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `leerplan_id` int(11) NOT NULL,
  `oefenreeks_id` int(11) NOT NULL,
  `plaats` int(11) NOT NULL,
  PRIMARY KEY (`leerplan_oefenreeks_id`),
  UNIQUE KEY `un_leerp_oefenr` (`leerplan_id`,`oefenreeks_id`),
  KEY `fk_leerp_oefenr_oefenreeks` (`oefenreeks_id`),
  CONSTRAINT `fk_leerp_oefenr_leerplan` FOREIGN KEY (`leerplan_id`) REFERENCES `leerplan` (`leerplan_id`) ON DELETE CASCADE,
  CONSTRAINT `fk_leerp_oefenr_oefenreeks` FOREIGN KEY (`oefenreeks_id`) REFERENCES `oefenreeks` (`oefenreeks_id`) ON DELETE CASCADE
) ENGINE=InnoDB DEFAULT CHARSET=latin1 ;

Para resumir, Sqlyog solo muestra los índices en su vista de árbol a la izquierda, si desea ver las claves externas, seleccione la tabla en la vista de árbol y presione F10.