La zona horaria de Mysql en Windows 7 no está actualizada

Solución:

Para aquellos que enfrentaron el mismo problema, esto es lo que encontré. Ejecuté show variables like 'datadir' y descubrí que mis archivos de datos están almacenados en una carpeta diferente:C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.5\data\

y estaba reemplazando archivos en la carpeta C:\Program Files... inicialmente. También estaban presentes los archivos necesarios.

Así que finalmente todo salió bien.