Como @Fabrice- El equipo de SonarQube sugirió que está ejecutando SonarQube Server sobre Mysql. Si desea verificar, puede hacerlo dentro del archivo Sonar.properties.
para eliminar estos problemas, debe modificar my.cnf (Linux) o my.ini (para Windows).
[mysqld]
max_allowed_packet=256M
si desea configurar lo mismo globalmente. Inicie sesión en Mysql y ejecute el siguiente comando.
SET GLOBAL max_allowed_packet=1073741824;
Una vez que realice esta configuración, reinicie el servidor Mysql.