last_insert_id() no tiene relación con tablas específicas. En la misma conexión, todas las mesas comparten lo mismo.
A continuación se muestra una demostración.
Demostración:
mysql> create table t1(c1 int primary key auto_increment);
Query OK, 0 rows affected (0.11 sec)
mysql> create table t2(c1 int primary key auto_increment);
Query OK, 0 rows affected (0.06 sec)
mysql> insert into t1 values(null);
Query OK, 1 row affected (0.01 sec)
mysql> insert into t2 values(4);
Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
mysql> insert into t2 values(null);
Query OK, 1 row affected (0.02 sec)
mysql> select last_insert_id() from t1;
+------------------+
| last_insert_id() |
+------------------+
| 5 |
+------------------+
1 row in set (0.00 sec)
