cómo codificar varias filas de mysql en json usando php

El problema es que $output es una matriz por la que debe pasar. Me gusta:

function getTopic($conn){
    $response = array("error" => 0);
    $qry = "SELECT original_title, content, time FROM topic WHERE vis = 1";
    $result = $conn->prepare($qry);
    $result->execute();
    if($result->rowCount() > 0){
        $output = $result->fetchall();
        foreach ($output as $o){
           $response['text'] = $o['original_title'];
           $response['test'] = $o['content'];
        }
        return json_encode($response);
    }
}

Esto es para la última respuesta, pero si quieres todas, haz:

function getTopic($conn){
    $response = array('error'=>0);
    $qry = "SELECT original_title, content, time FROM topic WHERE vis = 1";
    $result = $conn->prepare($qry);
    $result->execute();
    if($result->rowCount() > 0){
        $output = $result->fetchall();
        foreach ($output as $o){
           $response[] = array('text'=>$o['original_title'],'test'=>$o['content']);
        }
        return json_encode($response);
    }
}

Si solo desea una fila, agregue un límite a su declaración de MySQL.