Como dije en un comentario, me enfrentaba al mismo problema:necesitaba encontrar una forma de hacerlo @@session.time_zone = '+0:00' sin una instrucción SQL, configurando el controlador JDBC en su lugar.
Aquí está la solución si está usando propiedades (Dropwizard y quizás Spring):
sessionTimeZone: UTC
useLegacyDatetimeCode: false
O simplemente agréguelo a la URL de conexión de JDBC:?sessionTimeZone=UTC&useLegacyDatetimeCode=false
