¿Hay alguna forma de enviar una matriz json al php del lado del servidor e insertar sus valores en una tabla?

No necesita llamar a json_decode() dos veces. Ya lo decodificaste cuando lo hiciste

$decoded = json_decode($json);

por lo que no necesita usar json_decode($item) al insertar.

Usa el true segundo argumento para json_decode() para que cree una matriz asociativa en lugar de un objeto para cada elemento. Luego puede pasar esa matriz a $p->execute() directamente. También necesita usar $decoded['tab'] en lugar de $decoded->tab .

<?php

header("Access-Control-Allow-Origin: *");
header("Access-Control-Allow-Credentials: true ");
header('Access-Control-Allow-Methods: GET, PUT, POST, DELETE, OPTIONS');
header("Access-Control-Allow-Headers: X-Custom-Header, Origin, Content- 
Type , Authorisation , X-Requested-With");
header("Content-Type: application/json; charset=UTF-8 ");
$json = file_get_contents('php://input');
$decoded = json_decode($json, true);

$tab = $decoded['tab'];
function conn()
{
    $dbhost = "localhost";
    $user = "root";
    $pass = "";
    $db = "smart";
    $conn = new PDO('mysql:host=localhost;dbname=smart', $user, $pass);
    return $conn;
}
$db = conn();
$db->setAttribute(PDO::ATTR_ERRMODE, PDO::ERRMODE_EXCEPTION);
$p = $db->prepare("INSERT INTO regrouper (refCommande, refProduit, prixP, qteP)
                   VALUES(:refCmd,:refProduit,:prix,qte)");
foreach ($tab as $item) {
    $p->execute($item);
}
echo json_encode(true);