En lo que respecta a la exportación de datos, el Descargador masivo existe sólo para este propósito. De manera predeterminada, exporta a archivos CSV, pero puede escribir una clase Exportador personalizada que exporte directamente a una base de datos MySQL o cualquier otro formato de su elección.
También es posible alojar rápidamente un entorno alternativo de App Engine gracias a proyectos como AppScale . , (mío) BDBDatastore y TwistedAE .
En general, creo que sus preocupaciones sobre el escalado son infundadas:App Engine ya aloja muchas aplicaciones que reciben altos niveles de tráfico, pero eso depende en parte de su aplicación y sus necesidades. Por supuesto, soy parcial:pertenezco al equipo de App Engine, así que tome mi evaluación con pinzas.;)