Puedes JOIN
su consulta en la tabla principal como una subconsulta, para obtener las filas y los nombres de archivo originales:
SELECT
main.number,
main.file
FROM
table AS main
/* Joined against your query as a derived table */
INNER JOIN (
SELECT number, COUNT(*) AS sum domains
FROM table
WHERE RIGHT(file, 2) = '_1'
GROUP BY number
HAVING sum domains > 1
/* Matching `number` against the main table, and limiting to rows with _1 */
) as subq ON main.number = subq.number AND RIGHT(main.file, 2) = '_1'
http://sqlfiddle.com/#!2/cb05b/6
Tenga en cuenta que he reemplazado su LIKE '%_1'
con RIGHT(file, 2) = '_1'
. Sin embargo, es difícil saber cuál será más rápido sin un punto de referencia.