¡Esto es normal debido a la unión implícita que hiciste! ¿Por qué no simplemente solicita dos consultas, una por tabla, y luego combina los resultados en una matriz?
public function getcentrelist()
{
$this->load->database();
$query_courses= $this->db->query('SELECT course_name as name from tbl_training_courses');
$query_centers= $this->db->query('SELECT centre_name as name from tbl_traning_centres');
$courses = $query_courses->result();
$centers = $query_centers->result();
return array_merge($courses,$centers);
}
Tenga en cuenta que he cambiado el nombre de los campos nombre_del_curso y nombre del centro a un nombre unificado:"nombre", esto es necesario para tener una tabla fusionada coherente.