Cuando esté ejecutando desde el símbolo del sistema después de compilar su clase, use esto
java -classpath .;mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar Version
Mantenga tanto el archivo jar como el java en el mismo directorio e intente. usar ";" en lugar de ":" como se mencionó anteriormente. Incluya el nombre del paquete, si lo hay. He probado su funcionamiento.