Hemos decidido comenzar a usar el conector mysql .net en lugar del conector mysql odbc. Todo lo que hicimos fue cambiar de OdbcConnection a MySqlConnection, de OdbcCommand a MySqlCommand, de OdbcParameter a MySqlParameter. Ejecutamos un par de pruebas de aumento y parece que no solo ganamos estabilidad sino que también mejoramos el rendimiento. Entonces, como conclusión:use MySql Connector .NET en lugar de MySql Connector ODBC.