mysql cómo actualizar una columna de cada fila con un conjunto dado de valores

Podrías hacer algo como esto:

update table t
    set code = concat('code-', id)
    where id in (1, 2, 3);

Si los códigos no están realmente vinculados a las identificaciones, puede usar un case :

update table t
    set code = (case when id = 1 then 'code-1'
                     when id = 2 then 'code-2'
                     when id = 3 then 'code-3'
                end)
    where id in (1, 2, 3);