Usando una variable PHP antes de una consulta MYSQL

Además de la popular recomendación de no usar las funciones mysql_*,
debe asegurarse de no tener ningún espacio en blanco en los elementos de su matriz.

Aquí hay un código de ejemplo para eliminar y depurar la consulta en cada paso.

<?php

$elements = array('  element A', "\t Element B \r\n");

var_dump($elements);

/*
use var_dump to check your array elements for whitespace and such
array(2) {
  [0]=>
  string(11) "  element A"
  [1]=>
  string(14) "   Element B
"
}
*/

// create your IN clause string and verify it
$joinedString = "('" . join("','",array_map('trim',$elements)) . "')";

var_dump($joinedString);
/*
use var_dump not echo
string(25) "('element A','Element B')"

*/

// your query string finally becomes
$query = "SELECT * FROM smoelenboek 
WHERE sectie1 IN $joinedString 
OR sectie2 IN $joinedString 
OR sectie3 IN $joinedString 
OR sectie4 IN $joinedString 
OR sectie5 IN $joinedString 
AND actief='ja' ORDER BY achternaam ASC";

// and check it with var_dump and also run it in PhpMyAdmin
var_dump($query);
/*
string(280) "SELECT * FROM smoelenboek
WHERE sectie1 IN ('element A','Element B')
OR sectie2 IN ('element A','Element B')
OR sectie3 IN ('element A','Element B')
OR sectie4 IN ('element A','Element B')
OR sectie5 IN ('element A','Element B')
AND actief='ja' ORDER BY achternaam ASC"
*/