el cliente no admite el protocolo de autenticación solicitado por el servidor considere actualizar el cliente mysql

Django no genera automáticamente su base de datos. Debe crearlo primero antes de sincronizar o migrar. Además, debe instalar MySQLDB paquete en su lista de paquetes de python. Pero si está usando Python3, le sugiero que use PyMySQL y luego agregue estos en su settings.py

import pymysql

pymysql.install_as_MySQLdb()