Mire el ejemplo de AJAX en la documentación .
Básicamente, los pasos son:
1.) Extraer de la base de datos.
2.) Coloque los datos en la matriz de clave/valor de PHP de forma:
$dataSet1 = Array();
$dataSet1['label'] = 'Customer 1';
$dataSet1['data'] = Array(Array(1,1),Array(2,2)); // an array of arrays of point pairs
$dataSet2 = Array();
$dataSet2['label'] = 'Customer 2';
$dataSet2['data'] = Array(Array(3,3),Array(4,5)); // an array of arrays of point pairs
$returnArray = Array($dataSet1, $dataSet2);
3.) De vuelta en su javascript, obtenga esta cadena codificada json como variable JS:
var data = <?php echo json_encode($arr); ?>;
4.) De vuelta en su javascript, llame al método de diagrama flotante con esa variable de datos:
$.plot($("#placeholder"), data, options);