mysqldump también crea el volcado de claves foráneas... agrega sintaxis como:
mysql> SET foreign_key_checks = 0;
mysql> SOURCE dump_file_name;
mysql> SET foreign_key_checks = 1;
Puede leer el manual en:http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/create-table-foreign-keys.html para mysqldump de claves foráneas