He hecho esto en varias implementaciones usando un método como el siguiente. Hágalo en el modelo de usuario y no en el nivel de entidad de usuario.
void updateRoles(UserModel user, List<RoleModel> rolesToRemove, List<RoleModel> rolesToAdd)
{
for (RoleModel role : rolesToRemove)
{
user.deleteRoleMapping(role);
}
for (RoleModel role : rolesToAdd)
{
user.grantRole(role);
}
}