Grupo MySQL por intervalo específico de 24 horas

Puede hacerlo restando 5,5 horas y agregando por fecha:

select date_add(date(timestamp - interval (5*60 + 30) minute), interval (5*60 + 30)  minute) as interval_start,
       date_add(date(timestamp - interval (5*60 + 30) minute), interval (24*60 + 5*60 + 30)  minute) as interval_end,
       count(*) as cnt
from t
group by date(timestamp - interval (5*60 + 30) minute)
order by interval_start;