Puede usar mysqldump -A para generar volcados sql para todas las bases de datos.
Referencia:http://dev.mysql.com/doc/refman /5.1/es/mysqldump.html
Alternativamente, también puede simplemente copiar el directorio de datos reales.
Editar:disculpas por no ser específico, ya que otros han señalado que esto funcionará solo ISAM. Para innodb, deberá realizar una copia de seguridad utilizando mysqldump u otra utilidad como phpMyAdmin.
