Las tablas que mencionas pertenecen todas a mysql
base de datos, que es una base de datos del sistema. ¿Es perfectamente aceptable usar mysqldump en esa base de datos, pero una copia de seguridad incompleta de esa base de datos podría causar problemas de autenticación/autorización/funcionales si luego realiza ese volcado para restaurar la base de datos?
Estas tablas no deberían aparecer dentro de una base de datos regular. Si existen allí, sin duda indica algún error anterior, y simplemente debe eliminar estas tablas.
Si simplemente desea realizar ese volcado y no desea investigar el problema raíz, también es posible decirle a mysqldump que ignore las tablas que existen pero que le gustaría excluir de un archivo de volcado. La sintaxis de la opción es:--ignore-table=db_name.tbl_name
. Para excluir varias tablas, puede repetir ese argumento varias veces.