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Cambiar el color de la fuente del comentario en la consulta de MySQL Workbench

De hecho, lo que desea cambiar son los colores para el resaltado de sintaxis. Estos colores se almacenan en un archivo xml y actualmente no hay una GUI para cambiarlos. Pero puede editar el archivo xml directamente (reinicie MySQL Workbench para detectar cualquier cambio). Busque el archivo code_editor.xml en su directorio de instalación de MySQL Workbench.

Hay secciones para cada servidor MySQL compatible como:

<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<languages>
  <language name="SCLEX_MYSQL">
    <!-- This is the base language setting. It's usually not directly used, but provides values shared by
         more specialized MySQL versions. -->

    <!-- Lexer properties -->
    <property name="fold" value="1" />
    <property name="fold.compact" value="0" />
    <property name="fold.comment" value="1" />
    ...
    <style id="1" fore-color="#A0A0A0" /> <!-- SCE_MYSQL_COMMENT -->
    <style id="2" fore-color="#A0A0A0" /> <!-- SCE_MYSQL_COMMENTLINE -->
    ...
  </language>
  ...
</languages>

Hay etiquetas de estilo de número, cada una de las cuales especifica un color de fondo y de fondo (y un estilo como negrita, cursiva) para cada tipo de token. Aquí es donde puedes ajustar los colores a lo que quieras. Haz una copia del archivo original en caso de que necesites restaurarlo.