cómo devolver una selección mysql como una matriz de matrices en json usando php

Para json_encode para devolver una matriz JSON de matriz, necesita una matriz indexada numéricamente.

Esto se puede obtener con la siguiente función genérica:

    function SqlSelectToJsonTable($result,$withNames=false){
        // result a mysqli::query object, 
        // withNames: boolean, should the column names be returned as first row
        $return_arr = array();
        echo $result->num_rows;
        if ($result->num_rows > 0){
            if($withNames == true){
                $return_arr[0] = array();
                $fields = $result->fetch_fields();
                foreach ($fields as $field){
                    echo "column: ".$field->name." ";
                    array_push($return_arr[0],$field->name);
                }
            }
            while($row = $result->fetch_assoc()) {
                $return_arr[]= array_values($row);
            }
        } else {
            echo "0 results";
        }
        return json_encode($return_arr);
    }

Se usa como en lo siguiente:

    <?php
    $servername = "localhost";
    $username = "user";
    $password = "password";
    $dbname = "test";

    // Create connection
    $conn = new mysqli($servername, $username, $password, $dbname);
    // Check connection
    if ($conn->connect_error) {
        die("Connection failed: " . $conn->connect_error);
    } 

    $sql = "SELECT id, title FROM Posts";
    $result = $conn->query($sql);

    $jsonTable = SqlSelectToJsonTable($result);
    echo '<br/>'.$jsonTable;

    echo "<script type=\"text/javascript\">
        var jsTable = JSON.parse('".$jsonTable."');
        </script>";

    $conn->close();
    ?>

Donde jsTable será efectivamente una matriz de matrices. Tenga en cuenta la opción withNames lo que permite agregar los nombres de las columnas como la primera fila, útil si intenta pasar esta matriz a javascript para google visualización .