Si creó una base de datos INNODB y no realizó otros cambios de configuración para almacenar los datos reales en espacios de tablas separados, entonces todos los datos reales para esas bases de datos INNODB se habrán almacenado en \wamp\bin\mysql\mysql5.6.17\ibdata1
archivo.
Si no tiene ese archivo de la instalación anterior, sus datos se perderán.
También habrá información en un \wamp\bin\mysql\mysql5.6.17\data\DATA_BASE_NAME\
carpeta, un archivo .frm para cada tabla que estaba en la base de datos, pero esto es básicamente solo información de esquema y no datos reales.
Para referencia futura, InnoDB Backup and Recovery