Por defecto, se almacena en el directorio de datos de MySQL. Y puede verificar su directorio de datos con el comando:
show variables like 'datadir';
No puede almacenarlo localmente con este comando ejecutándose en un servidor remoto, necesita descargar el archivo desde el servidor.
También puede usar este comando:
SELECT * FROM table INTO OUTFILE 'mysqlresults.csv' FIELDS TERMINATED BY ','OPTIONALLY ENCLOSED BY '"' LINES TERMINATED BY '\n' ;