Este es un tiempo de espera de conexión MySQL común, necesita configurar el grupo de conexiones para verificar que la conexión devuelta esté activa, lea la documentación relacionada "evitar tiempos de espera de inactividad de la base de datos " :
use una consulta de validación en la configuración del grupo de conexiones:
<param name="validationQuery" value="SELECT 1" />
también debería considerar usar enlace de base de datos , ya que cloudbees-web.xml está en desuso:
bees app:bind -a APP_ID -db DB_ID validationQuery="SELECT 1"