mysql SELECT * DONDE valor =$fila['elemento']

El mejor enfoque más apropiado es usar mysqli y declaraciones preparadas, es decir:

$stmt = $mysqli->prepare("SELECT * FROM table WHERE value =?");
$stmt->bind_param("s",$row['item']);  // I am assuming row['item'] is a string
$stmt->execute();

Si no puede usar mysqli o se niega absolutamente a hacerlo, puede usar esto:

$query = "SELECT * FROM table WHERE value = '".mysql_real_escape_string($row['item'])."'";