Descubrí que esto ocurría cuando MySQL consumía demasiada RAM. Esta pregunta y esta publicación ambos ayudaron con una forma de probar y una solución.
Para mí, agregar esto a mi /etc/mysql/my.cnf El archivo solucionó el problema.
innodb_buffer_pool_size = 12M
Así es como decidí cuánta memoria asignar. Inicie todo menos MySQL y verifique cuánta memoria hay libre. Configure su búfer InnoDB al 10% de esa cantidad. Para mí fueron las 12M.
