Aquí se puede encontrar una solución realmente fea:
http://angkatbahu.blogspot .com.es/2011/03/mysql-loadfile-function-in-ubuntu-it_12.html
Si coloca los archivos que desea cargar en el directorio /var/lib/mysql/all_images, ¡funciona!
Probado en ubuntu 12.10 (y no, la transferencia de archivos al usuario mysql no funcionó)