Cómo configurar AUTO_INCREMENT desde otra tabla

Este código creará un procedimiento para usted:

CREATE PROCEDURE `tbl_wth_ai`(IN `ai_to_start` INT)
BEGIN

SET @s=CONCAT('CREATE TABLE IF NOT EXISTS `table_name` (
  `id` mediumint(6) unsigned NOT NULL AUTO_INCREMENT,
  `columnOne` tinyint(1) NOT NULL,
  `columnTwo` int(12) NOT NULL,
  PRIMARY KEY (`id`)
) ENGINE=MyISAM DEFAULT CHARSET=utf8 AUTO_INCREMENT = ', `ai_to_start`);

  PREPARE stmt FROM @s;
  EXECUTE stmt;
  DEALLOCATE PREPARE stmt;
END;

Entonces puede llamar a CALL tbl_wth_ai(2); pasando el parámetro dentro de los corchetes.

Por ejemplo:

CALL tbl_wth_ai((SELECT id FROM `ttest` WHERE c1='b'));