No creo que el alojamiento de Windows permita PHP5.ini personalizado :(
Revisé su sitio de ayuda y ese artículo al que se vinculó era para servidores Linux.
Además, compara planes en esta página:http://www.godaddy .com/gdshop/hosting/shared.asp?ci=9009 muestra que Linux permite PHP5.ini personalizado pero no Windows
Me pregunto si tratar de usar uno estropea el PHP y hace que la función "mysql_connect" que está tratando de usar no esté disponible.