No creo que pueda configurar su base de datos para almacenar la hora sin la referencia de tipo de datos TIME de SS.MySQL:http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/es/tiempo.html
Deberá establecer el formato en HH:MM en la consulta mysql o en php después de extraer los datos.
En PHP:
$date = date('H:i', strtotime($db_date_value));
http://us3.php.net/manual/en/function.date .php
En MySQL:
DATE_FORMAT(date_created, "%H:%i") as date_created
http://dev .mysql.com/doc/refman/5.1/en/date-and-time-functions.html#function_date-format
