Te refieres a esto:
select
a.project_id,
b.list_id,
c.item_id
from
projects a
join lists b
on a.project_id=b.project_id
join items c
on b.list_id=c.list_id
La salida será algo como:
project_id | list_id | item_id
1 | 5 | 45
1 | 5 | 46
1 | 8 | 12
¿O quería devolver todas las partes en una sola fila?
Si desea una sola fila, puede hacer algo como:
select
a.project_id,
group_concat(b.list_id) as listIDs,
group_concat(c.item_id) as itemIDs
from
projects a
join lists b
on a.project_id=b.project_id
join items c
on b.list_id=c.list_id
Pero se volverá más complicado en PHP para lidiar con todas las cosas agrupadas.
La salida será algo como:
project_id | list_id | item_id
1 | 5,8 | 45, 46, 12
También puede mezclar y combinar los dos para obtener lo mejor de ambos mundos:
select
a.project_id,
b.list_id as listIDs,
group_concat(c.item_id) as itemIDs
from
projects a
join lists b
on a.project_id=b.project_id
join items c
on b.list_id=c.list_id
La salida será algo como:
project_id | list_id | item_id
1 | 5 | 45, 46
1 | 8 | 12