Tuve este mismo problema con la última versión de MySQL Workbench (macOS). Definitivamente es un error como anteriormente, no tuve ningún problema con la ingeniería avanzada.
Aquí hay una solución alternativa:
Normalmente, irías a:
Database > Forward Engineer...
Para evitar este error, vaya a:
Database > Synchronize Model...- Esto buscará cualquier ERD abierto que no exista actualmente con el resto de sus esquemas y le permitirá reenviar el esquema de esa manera.
- Advertencia:esto podría complicarse si tuviera muchos ERD abiertos y no quisiera sincronizarlos todos, ¡así que asegúrese de verificar los correctos!
Sé que esta es una respuesta tardía, pero esta solución me permitió reenviar un ERD que anteriormente no se activaba (tal como lo describiste, nada de MySQL Workbench).
Encontré su publicación cuando intentaba encontrar una solución y, mientras solucionaba el problema, escuché una anécdota personal sobre esta solución. Es posible que ya esté publicado en otro lugar de la pila (traté de encontrar el enlace pero no pude encontrarlo), pero espero que esto ayude :)
