Un par de opciones:
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Invierta en una herramienta de transformación de datos que se conecte a NetSuite y DB2 o MySQL. Mire Dell Boomi, IBM Cast Iron, etc. Estas herramientas le permiten conectarse a ambos sistemas, definir los datos que se extraerán, realizar funciones de transformación de datos y mapeos y hacer todas las inserciones/actualizaciones o lo que necesite hacer.
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Para MySQL a NetSuite, se pueden escribir scripts php para acceder a MySQL y NetSuite. En el lado de NetSuite, puede hacer servicios web SOAP o puede escribir API REST personalizadas dentro de NetSuite. SOAP es probablemente un poco más lento que REST, pero con REST, debe escribir la API usted mismo (JavaScript del lado del servidor; no es difícil, pero hay una curva de aprendizaje).
Espero que esto ayude.